연구 사례

표적에 붙을 단백질 후보를 설계합니다

붙이고 싶은 표적과 부위를 정하고, 설계·예측·선별을 반복해 실험할 후보를 좁힙니다.

BindCraft

특정 표적에 붙을 단백질 후보를 찾고 싶다면

준비할 자료부터 결과를 읽는 방법까지 차례로 살펴보세요.

01표적·관심 부위 지정 설명용 분자 그림

표적·관심 부위 지정

표적 구조와 설계 길이 준비

02결합 후보 설계 설명용 분자 그림

결합 후보 설계

AlphaFold 2·MPNN 등 도구 연결

03조건에 맞는 후보 선별 설명용 분자 그림

조건에 맞는 후보 선별

구조·접촉·품질 기준 검토

04실제 결합 확인 설명용 분자 그림

실제 결합 확인

실험에서 결합과 기능 측정

공개된 단백질 구조로 연구 순서를 설명한 그림입니다. 실제 계산 결과는 아닙니다.

준비와 결과

무엇을 넣고, 무엇을 얻나요?

준비할 자료

표적 구조와 설계 조건

표적 단백질의 구조와 관심 부위를 준비합니다.

후보 길이와 선별할 때 확인할 조건을 정합니다.

계산 후 받는 것

후보 서열·구조와 선별 지표

표적에 붙도록 설계한 단백질 서열과 구조 후보

계산 과정에서 후보를 선별한 지표

결과 읽기

숫자와 모양에서
무엇을 확인해야 할까요?

표적과 맞닿는 부분, 구조의 신뢰도, 선별 조건을 함께 봅니다.

계산에서 조건을 통과해도 실제 결합이나 치료 효과가 확인된 것은 아닙니다.

조건에 맞는 후보 선별를 설명하는 그림

조건에 맞는 후보 선별

구조·접촉·품질 기준 검토

다음 연구

남은 후보가 실제 표적에 붙는지, 기대한 기능을 하는지 실험으로 확인합니다.

다시 살펴볼 수 있도록

결과와 함께
사용한 조건도 남깁니다.

나두바이오에서 수행한 작업은 입력 자료와 도구 버전, 계산 조건을 결과와 함께 확인하는 흐름으로 이어집니다.

BindCraft

기록 미리보기
사용한 자료

표적 구조와 설계 조건

원본 자료와 계산 조건

계산 결과

후보 서열·구조와 선별 지표

결과 파일과 실행 이력

연구의 출처

원문에서 더 자세히 살펴보세요

연구의 배경은 원문 논문에서, 입력과 결과의 구체적인 형식은 공식 문서에서 확인할 수 있습니다.

  1. BindCraft: one-shot design of functional protein binders

    DOI: 10.1101/2024.09.30.615802

  2. BindCraft 공식 사용 문서

    이 페이지에서 참고한 부분: README: 표적 설정, 설계 파라미터, 필터, 실험 후보 선정

입력과 연구 순서는 2026년 10월 2일 확인한 공식 사용 문서를 참고했습니다. 그림은 과정을 설명하기 위한 예시이며, 실제 계산 결과는 아닙니다.

그림은 공개 구조를 참고해 설명하기 쉽게 그렸습니다. 참고한 PDB 구조 보기