활용 사례

어떤 연구를 하고 싶으신가요?

가지고 있는 자료와 다음에 확인할 질문을 기준으로 연구 과정을 살펴보세요.

공식 문서에서 소개하는 연구 과정을 모았습니다. 지금 사용할 수 있는 도구는 이용 안내에서 확인하세요.

서열 준비예측 신뢰도 검토
AlphaFold 2

서열에서 단백질 모양을 예측합니다

단백질의 구성 순서를 바탕으로 입체 구조를 예측하고, 더 살펴볼 부분을 찾습니다.

기준 구조 준비서열 후보 생성
ProteinMPNN

같은 골격에 맞는 새 서열을 설계합니다

이미 가진 단백질 구조에서 유지할 부분을 정하고, 새로운 서열 후보를 만듭니다.

설계 조건 지정골격에 맞는 서열 설계
RFdiffusion + ProteinMPNN

새 골격부터 단백질 후보를 만듭니다

원하는 길이와 조건으로 골격을 만들고, 그 골격에 맞는 서열을 이어서 설계합니다.

표적·관심 부위 지정조건에 맞는 후보 선별
BindCraft

표적에 붙을 단백질 후보를 설계합니다

붙이고 싶은 표적과 부위를 정하고, 설계·예측·선별을 반복해 실험할 후보를 좁힙니다.

구성 분자 준비접촉·신뢰도 검토
Boltz-2

함께 있을 때의 분자 모양을 예측합니다

단백질과 작은 분자의 정보를 함께 넣고, 서로 어떤 위치에 놓일지 살펴봅니다.

구조·주변 분자 준비새 단백질 서열 설계
LigandMPNN

주변 분자까지 고려해 서열을 설계합니다

단백질 가까이에 있는 작은 분자의 원자 정보를 참고해, 주변 서열 후보를 설계합니다.

항체·표적 구조 준비구간의 서열·구조 설계
DiffAb

항체의 표적 인식 구간을 다시 설계합니다

항체의 전체 틀과 표적 정보를 바탕으로, 표적 인식에 관여하는 구간을 설계합니다.

기준 구조 준비안정성 변화 예측
ThermoMPNN

아미노산을 바꾸면 더 안정해질까요?

한 위치를 바꾼 후보가 단백질의 접힘 안정성에 어떤 영향을 줄지 계산해 봅니다.

분자와 표적 준비가능한 결합 자세 계산
AutoDock Vina

작은 분자가 들어갈 자리를 탐색합니다

표적의 관심 부위에서 여러 결합 자세를 계산하고, 더 검토할 분자 후보를 좁힙니다.

시작 구조 준비시간에 따른 움직임 계산
GROMACS · 분자 동역학

정지된 구조에서, 시간에 따른 움직임으로

물과 주변 환경을 포함한 계산 조건에서 구조가 어떻게 움직이는지 살펴봅니다.