연구 사례

아미노산을 바꾸면 더 안정해질까요?

한 위치를 바꾼 후보가 단백질의 접힘 안정성에 어떤 영향을 줄지 계산해 봅니다.

ThermoMPNN

아미노산 하나를 바꾸면 구조가 더 안정해질지 궁금하다면

준비할 자료부터 결과를 읽는 방법까지 차례로 살펴보세요.

01기준 구조 준비 설명용 분자 그림

기준 구조 준비

변경 전 단백질 구조 사용

02변이 후보 지정 설명용 분자 그림

변이 후보 지정

한 위치의 아미노산 변경 검토

03안정성 변화 예측 설명용 분자 그림

안정성 변화 예측

ThermoMPNN으로 후보별 계산

04실험에서 비교 설명용 분자 그림

실험에서 비교

동일한 조건에서 안정성 측정

공개된 단백질 구조로 연구 순서를 설명한 그림입니다. 실제 계산 결과는 아닙니다.

준비와 결과

무엇을 넣고, 무엇을 얻나요?

준비할 자료

원본 구조와 한 위치의 변이

변경 전 단백질 구조를 준비합니다.

한 위치의 아미노산을 무엇으로 바꿀지 정합니다.

계산 후 받는 것

후보별 안정성 변화 예측

변이 후보별 접힘 안정성 변화 예측

같은 기준으로 후보를 비교할 계산값

결과 읽기

숫자와 모양에서
무엇을 확인해야 할까요?

한 위치를 바꾸는 ThermoMPNN의 범위로 설명합니다. 여러 위치를 바꾸는 별도 모델과 구분합니다.

값의 부호와 정의를 확인해야 합니다. 실험에서 잰 열 안정성이나 약효로 읽지 않습니다.

안정성 변화 예측를 설명하는 그림

안정성 변화 예측

ThermoMPNN으로 후보별 계산

다음 연구

동일한 조건에서 안정성을 측정해 예측과 비교합니다.

다시 살펴볼 수 있도록

결과와 함께
사용한 조건도 남깁니다.

나두바이오에서 수행한 작업은 입력 자료와 도구 버전, 계산 조건을 결과와 함께 확인하는 흐름으로 이어집니다.

ThermoMPNN

기록 미리보기
사용한 자료

원본 구조와 한 위치의 변이

원본 자료와 계산 조건

계산 결과

후보별 안정성 변화 예측

결과 파일과 실행 이력

연구의 출처

원문에서 더 자세히 살펴보세요

연구의 배경은 원문 논문에서, 입력과 결과의 구체적인 형식은 공식 문서에서 확인할 수 있습니다.

  1. Transfer learning to leverage larger datasets for improved prediction of protein stability changes

    DOI: 10.1073/pnas.2314853121

  2. ThermoMPNN 공식 사용 문서

    이 페이지에서 참고한 부분: README: 모델 파생판 구분, Inference — From a PDB / From a CSV

입력과 연구 순서는 2026년 10월 2일 확인한 공식 사용 문서를 참고했습니다. 그림은 과정을 설명하기 위한 예시이며, 실제 계산 결과는 아닙니다.

그림은 공개 구조를 참고해 설명하기 쉽게 그렸습니다. 참고한 PDB 구조 보기

로그인 없이 먼저 살펴보세요

이 연구에 쓰는 도구

모델 카탈로그에서 제공하는 입력 항목과 이용 안내를 여기서 바로 확인할 수 있습니다. 내 자료로 작업을 준비할 때 로그인하세요.

  • 열안정성단일 위치 변이개발 적합성변이 평가결합 친화도 최적화

    입력 항목 확인 가능 · 실행 준비 중

    ThermoMPNN

    단백질 구조를 바탕으로 서열 변이가 접힘 안정성에 미치는 영향을 예측합니다.

    주요 입력 데이터
    단백질 구조 (PDB)
    입력 항목 4개
전체 모델 카탈로그 보기