기준 구조 준비
단백질의 골격 구조 입력
연구 사례
같은 골격에 맞는 새 서열을 설계합니다
이미 가진 단백질 구조에서 유지할 부분을 정하고, 새로운 서열 후보를 만듭니다.
준비와 결과
무엇을 넣고, 무엇을 얻나요?
PDB 구조
기준이 되는 단백질 구조 파일을 준비합니다.
바꿀 사슬과 위치, 그대로 둘 부분을 구분합니다.
FASTA 후보 서열
구조에 맞춰 제안한 여러 후보 서열
생성 조건과 도구가 제공하는 서열 점수
결과 읽기숫자와 모양에서
숫자와 모양에서
무엇을 확인해야 할까요?
고정하기로 한 위치가 유지됐는지 확인합니다.
서열 점수는 실험 성공률이 아닙니다. 후보를 고르는 참고 자료로 봅니다.
서열 후보 생성
ProteinMPNN으로 여러 서열 설계
다음 연구
후보 서열로 구조를 다시 예측하고, 실제로 접히며 원하는 기능을 하는지는 실험에서 확인합니다.
다시 살펴볼 수 있도록결과와 함께
결과와 함께
사용한 조건도 남깁니다.
나두바이오에서 수행한 작업은 입력 자료와 도구 버전, 계산 조건을 결과와 함께 확인하는 흐름으로 이어집니다.
ProteinMPNN
기록 미리보기사용한 자료
PDB 구조
원본 자료와 계산 조건
계산 결과
FASTA 후보 서열
결과 파일과 실행 이력
원문에서 더 자세히 살펴보세요
연구의 배경은 원문 논문에서, 입력과 결과의 구체적인 형식은 공식 문서에서 확인할 수 있습니다.
- Robust deep learning-based protein sequence design using ProteinMPNN.
DOI: 10.1126/science.add2187
- ProteinMPNN 공식 사용 문서
이 페이지에서 참고한 부분: README: input flags, fixed positions/chains, Output example
입력과 연구 순서는 2026년 10월 2일 확인한 공식 사용 문서를 참고했습니다. 그림은 과정을 설명하기 위한 예시이며, 실제 계산 결과는 아닙니다.
그림은 공개 구조를 참고해 설명하기 쉽게 그렸습니다. 참고한 PDB 구조 보기
이 연구에 쓰는 도구
모델 카탈로그에서 제공하는 입력 항목과 이용 안내를 여기서 바로 확인할 수 있습니다. 내 자료로 작업을 준비할 때 로그인하세요.
프로젝트에서 실행 · 조직의 버전 허용 필요
ProteinMPNN
단백질의 입체 구조에 맞는 아미노산 서열 후보를 설계합니다.
- 주요 입력 데이터
- 단백질 구조 (PDB)
입력 항목 5개