연구 도구 설명

구조에 맞는 새 서열을 설계하세요.

이미 가진 단백질 구조에서 유지할 부분을 정하고, 새로운 서열 후보를 만듭니다.

ProteinMPNN
01기준 구조 준비 설명용 분자 그림

기준 구조 준비

단백질의 골격 구조 입력

02설계할 부분 지정 설명용 분자 그림

설계할 부분 지정

고정할 위치와 변경 범위 구분

03서열 후보 생성 설명용 분자 그림

서열 후보 생성

ProteinMPNN으로 여러 서열 설계

04구조를 다시 검토 설명용 분자 그림

구조를 다시 검토

별도 구조 예측 후 실험 대상 선정

공개된 단백질 구조로 연구 순서를 설명한 그림입니다. 실제 계산 결과는 아닙니다.

어떤 자료가 필요한가요?

단백질 구조 파일을 준비하고 바꿀 부분과 유지할 부분을 구분합니다.

단백질 구조 파일

입력 필요

분자의 3차원 좌표가 포함된 구조 파일을 준비하세요.

단백질 구조 (PDB).pdb.cif

설계할 아미노산 위치

입력 필요

사슬별 아미노산 위치를 지정합니다. 사슬 식별자와 구조의 번호를 함께 확인하세요.

사슬별 서열 구간위치 목록 표기 · 구분자: 공백
입력 예시
B: 26 27 28 29 30 31 32 52 53 54 55 56 95 96 97 98 99 100 101 102
구조에 맞게 제안된 서열도 실제로 접히고 원하는 기능을 하는지 확인해야 합니다.
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이 연구에 쓰는 도구

모델 카탈로그에서 제공하는 입력 항목과 이용 안내를 여기서 바로 확인할 수 있습니다. 내 자료로 작업을 준비할 때 로그인하세요.

  • 구조 기반 서열 설계단백질 설계결합 친화도 최적화

    프로젝트에서 실행 · 조직의 버전 허용 필요

    ProteinMPNN

    단백질의 입체 구조에 맞는 아미노산 서열 후보를 설계합니다.

    주요 입력 데이터
    단백질 구조 (PDB)
    입력 항목 5개
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