참조도구 참조

RFdiffusion

범용 de novo 단백질 설계 — 바인더/모티프 스캐폴딩/대칭 올리고머 등 8가지 프로토콜

제출에 쓰는 식별자는 rfdiffusion 입니다. 표시 이름과 다르며 번역하지 않습니다.

범용 de novo 단백질 설계 — 바인더/모티프 스캐폴딩/대칭 올리고머 등 8가지 프로토콜

분류: protein-design, binder-design, affinity-optimization, motif-scaffolding

이 도구는 task 값에 따라 입력 구성이 달라집니다.

입력 설정

설정형식필수기본값설명과 제약
tasktask선택"Motif Scaffolding"실행 프로토콜 — 기본값은 Motif Scaffolding이므로 바인더 설계 시 명시 필요 — 허용값 Custom Contigs · Binder Design · Binder Redesign · Motif Scaffolding · Partial Diffusion · Symmetric Oligomer · Symmetric Motif Scaffolding
pdbFilepdb필수—확장자 pdb · cif, 분기 Custom Contigs · Binder Design · Binder Redesign · Motif Scaffolding · Partial Diffusion · Symmetric Motif Scaffolding
contigsstring필수—컨티그 표기 (예: 100-140) — 분기 Custom Contigs
targetChainschains필수—JSON 배열, 분기 Binder Design, 예 ["A"]
binderLengthstring필수—바인더 길이 또는 범위 (예: 70-90) — 분기 Binder Design, 예 "70-90"
designedChainchain필수—분기 Partial Diffusion, 예 "A"
designedResiduesselectResidues필수—분기 Binder Redesign, 예 "26-32,52-57,99-110"
diffusedResiduesselectResidues필수—분기 Partial Diffusion, 예 "1-5, 7-10"
interfaceResiduesselectResidues필수—분기 Motif Scaffolding, 예 "30-40, 60-70"
symmetryTypedropdown필수—허용값 c2 · c3 · c4 · c5 · c6 · d2 · d3 · d4 · tetrahedral, 분기 Symmetric Oligomer · Symmetric Motif Scaffolding
oligomerLengthnumber필수—분기 Symmetric Oligomer
motifResiduesstring필수—분기 Symmetric Motif Scaffolding
numDesignsnumber선택8설계 개수 — 생성형 기본값이 크므로 확인 요망 — 최소 1, 최대 1000

실행 가능 여부

이 쪽은 도구의 입력과 산출 계약을 설명합니다. 카탈로그에 있다는 것이 지금 실행할 수 있다는 뜻은 아닙니다. 실행 가능 여부는 도구별 실행 허가와 계획 정책이 정하며 이 쪽에서 판단하지 않습니다.

라이선스

상류 공개 저장소 기준 참고 정보입니다. 나두바이오가 실행하는 판의 사용 권리는 릴리스마다 따로 검토하며, 실행하는 판의 라이선스 원문은 제3자 고지에 있습니다.

구성라이선스상업 이용근거비고
코드BSD-3-Clause상업 이용 가능라이선스 원문—
모델 가중치BSD-3-Clause상업 이용 가능라이선스 원문LICENSE가 소스와 README의 다운로드 가중치를 함께 다룬다고 적고 있습니다

확인일 2026-10-02.

참고

PSI-BLAST Search

반복 프로파일 검색으로 동족 시퀀스 탐색

Table Tool

실행 계약 점검용 표 생성 도구 (개발/스모크 테스트). 과학적 예측이 아니다

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