ProteinMPNN

제출에 쓰는 식별자는 proteinmpnn 입니다. 표시 이름과 다르며 번역하지 않습니다.

백본 구조로부터 시퀀스 설계 (역폴딩)

분류: inverse-folding, protein-design, affinity-optimization

입력 설정

설정	형식	필수	기본값	설명과 제약
`pdbFile`	pdb	필수	—	설계할 백본 구조 — 확장자 `pdb` · `cif`
`designedResidues`	selectMultichainResidues	필수	`{}`	체인별 설계할 잔기 (비워두면 전체 설계) — 예 `\{"B":"26 27 28 29 30 31 32 52 53 54 55 56 95 96 97 98 99 10…`
`numSequences`	number	선택	`8`	생성 시퀀스 수 — 최소 1, 최대 100
`samplingTemp`	number	선택	`0.1`	낮을수록 결정론적
`omitAA`	string	선택	—	제외할 아미노산 (예: C)

열	표시 이름	범위	설명
`score`	MPNN score	—	설계 위치의 평균 음의 로그우도. 낮을수록 모델이 이 골격에 더 잘 맞는 서열로 본다는 뜻이며, 결합·안정성·실험 성공 확률이 아니다
`global_score`	전체 score	—	모든 위치에 대한 같은 점수
`seq_recovery`	원래 서열 일치율	`0~1`	설계 위치에서 입력 서열과 같은 아미노산의 비율(0–1). 높다고 더 좋은 설계라는 뜻은 아니다

지표가 무엇을 뜻하고 무엇을 뜻하지 않는지는 결과 읽는 법을 보세요. 범위는 값이 놓이는 구간이며 좋고 나쁨의 방향이 아닙니다.

이 쪽은 도구의 입력과 산출 계약을 설명합니다. 카탈로그에 있다는 것이 지금 실행할 수 있다는 뜻은 아닙니다. 실행 가능 여부는 도구별 실행 허가와 계획 정책이 정하며 이 쪽에서 판단하지 않습니다.

상류 공개 저장소 기준 참고 정보입니다. 나두바이오가 실행하는 판의 사용 권리는 릴리스마다 따로 검토하며, 실행하는 판의 라이선스 원문은 제3자 고지에 있습니다.

구성	라이선스	상업 이용	근거	비고
코드	`MIT`	상업 이용 가능	라이선스 원문	—
모델 가중치	`MIT`	상업 이용 가능	라이선스 원문	가중치가 같은 저장소에 들어 있습니다

확인일 2026-10-02.