참조도구 참조
AlphaFold
고정밀 단백질 구조 예측 (모노머/멀티모머). MSA 자동 주입
제출에 쓰는 식별자는 alphafold 입니다. 표시 이름과 다르며 번역하지 않습니다.
고정밀 단백질 구조 예측 (모노머/멀티모머). MSA 자동 주입
분류: structure-prediction, protein-protein-docking
입력 설정
| 설정 | 형식 | 필수 | 기본값 | 설명과 제약 |
|---|---|---|---|---|
sequence | sequence | 필수 | — | 문자 ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY: , 미지잔기 X-stripped, 최대 길이 5000, 예 "MALKSLVLLSLLVLVLLLVRVQPSLGKETAAAKFERQHMDSSTSAASSSNYCNQMMKS… |
numModels | dropdown | 선택 | "5" | 생성할 모델 수 (가중치 5세트) — 허용값 1 · 2 · 3 · 4 · 5 |
numRecycles | number | 선택 | 3 | 재순환 횟수 — 정확도/시간 트레이드오프 — 최소 0, 최대 20 |
numRelax | number | 선택 | 0 | amber relaxation 적용 모델 수 — 최소 0, 최대 5 |
useMSA | boolean | 선택 | true | MSA 사용 (끄면 single-sequence 모드) |
modelType | dropdown | 선택 | "auto" | 가중치 셋 선택 (auto: 모노머=ptm, 복합체=multimer_v3) — 허용값 auto · alphafold2_ptm · alphafold2_multimer_v1 · alphafold2_multimer_v2 · alphafold2_multimer_v3 · deepfold_v1 · alphafold2 |
randomSeed | number | 선택 | — | 재현용 시드 |
산출 지표
| 열 | 표시 이름 | 범위 | 설명 |
|---|---|---|---|
plddt | avg pLDDT | 0~100 | — |
ptm | pTM | 0~1 | — |
iptm | ipTM | 0~1 | 복합체 인터페이스 신뢰도 (0.8+ 권장) |
rank | rank | — | — |
지표가 무엇을 뜻하고 무엇을 뜻하지 않는지는 결과 읽는 법을 보세요. 범위는 값이 놓이는 구간이며 좋고 나쁨의 방향이 아닙니다.
실행 가능 여부
이 쪽은 도구의 입력과 산출 계약을 설명합니다. 카탈로그에 있다는 것이 지금 실행할 수 있다는 뜻은 아닙니다. 실행 가능 여부는 도구별 실행 허가와 계획 정책이 정하며 이 쪽에서 판단하지 않습니다.
라이선스
상류 공개 저장소 기준 참고 정보입니다. 나두바이오가 실행하는 판의 사용 권리는 릴리스마다 따로 검토하며, 실행하는 판의 라이선스 원문은 제3자 고지에 있습니다.
| 구성 | 라이선스 | 상업 이용 | 근거 | 비고 |
|---|---|---|---|---|
| 코드 | Apache-2.0 | 상업 이용 가능 | 라이선스 원문 | — |
| 모델 가중치 | CC-BY-4.0 | 조건부(비고 참고) | 저장소 안내문 | AlphaFold 2 파라미터. 출처 표기 의무(CC BY 4.0). AlphaFold 3은 별도 조건이며 여기 해당하지 않습니다 |
확인일 2026-10-02.