Boltz-2

AlphaFold3 재구현 — 단백질/핵산/소분자 복합체 예측 및 친화도

제출에 쓰는 식별자는 boltz 입니다. 표시 이름과 다르며 번역하지 않습니다.

AlphaFold3 재구현 — 단백질/핵산/소분자 복합체 예측 및 친화도

분류: structure-prediction, protein-protein-docking, protein-ligand-docking, binding-affinity

이 도구는 inputFormat 값에 따라 입력 구성이 달라집니다.

결합 위치 조건(restraints)을 입력으로 받습니다.

입력 설정

설정	형식	필수	기본값	설명과 제약
`inputFormat`	task	선택	`"sequence"`	입력 형식 — list는 FASTA 목록 업로드 — 허용값 `sequence` · `list` · `molecules` · `yaml`
`sequence`	sequence	필수	—	':'로 체인 구분. X 잔기 허용 — 문자 `ACDEFGHIKLMNPQRSTVWYX:`, 분기 `sequence`
`listFile`	file	필수	—	FASTA/시퀀스 목록 파일 — 확장자 `txt` · `fa` · `fasta`, 분기 `list`
`molecules`	molecules	필수	—	JSON 배열, 분기 `molecules` · `list`, 예 `[\{"type":"protein","sequence":"TRPNHTIYINNLNEKIKKDELKKSLHAI…`
`proteinMsaMode`	dropdown	필수	—	단백질의 MSA 출처. 현재는 품질 저하 가능성을 확인한 단일 서열 시험만 지원 — 허용값 `single-sequence`, 분기 `molecules`, 예 `"single-sequence"`
`yamlFile`	file	필수	—	Boltz YAML. MSA 경로와 자료는 파일 안에서 연구자가 명시해야 합니다. — 확장자 `yaml` · `yml`, 분기 `yaml`
`numSamples`	number	선택	`1`	생성 샘플 수 — 최소 1, 최대 64
`numRecycles`	number	선택	`3`	최소 0, 최대 10
`stepScale`	number	선택	`1`	낮을수록 다양성 증가 (1~2 권장)
`seed`	number	선택	—	재현용 시드 (비우면 랜덤)
`version`	dropdown	선택	`"2.2.1"`	boltz 코드 버전 (github.com/jwohlwend/boltz/releases) — 허용값 `2.2.1` · `1.0.0` · `0.4.0`

열	표시 이름	범위	설명
`confidence_score`	종합 신뢰도	`0~1`	Boltz 종합 신뢰도(0–1). 실험 성공 확률이나 결합 친화도가 아니다
`complex_plddt`	평균 pLDDT (0–1)	`0~1`	Boltz의 0–1 척도 그대로. 100을 곱해 다른 도구의 pLDDT와 비교하지 않는다
`ptm`	pTM	`0~1`	—
`iptm`	ipTM	`0~1`	사슬 사이 경계면 신뢰도. 사슬이 하나면 정의되지 않아 비어 있다

지표가 무엇을 뜻하고 무엇을 뜻하지 않는지는 결과 읽는 법을 보세요. 범위는 값이 놓이는 구간이며 좋고 나쁨의 방향이 아닙니다.

이 쪽은 도구의 입력과 산출 계약을 설명합니다. 카탈로그에 있다는 것이 지금 실행할 수 있다는 뜻은 아닙니다. 실행 가능 여부는 도구별 실행 허가와 계획 정책이 정하며 이 쪽에서 판단하지 않습니다.

상류 공개 저장소 기준 참고 정보입니다. 나두바이오가 실행하는 판의 사용 권리는 릴리스마다 따로 검토하며, 실행하는 판의 라이선스 원문은 제3자 고지에 있습니다.

구성	라이선스	상업 이용	근거	비고
코드	`MIT`	상업 이용 가능	라이선스 원문	—
모델 가중치	`MIT`	상업 이용 가능	저장소 안내문	README에 코드와 가중치 모두 MIT로 적혀 있습니다

확인일 2026-10-02.